Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELLP55199 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELLP55199 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms