Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARSP54136 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARSP54136 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARSP54136 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARSP54136 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARSP54136 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARSP54136 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARSP54136 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARSP54136 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARSP54136 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARSP54136 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARSP54136 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARSP54136 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARSP54136 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARSP54136 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARSP54136 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARSP54136 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARSP54136 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARSP54136 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARSP54136 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARSP54136 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARSP54136 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms