Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP3M2P53677 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP3M2P53677 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AP3M2P53677 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP3M2P53677 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AP3M2P53677 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M2P53677 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3M2P53677 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3M2P53677 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms