Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPAP53621 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPAP53621 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPAP53621 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPAP53621 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPAP53621 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPAP53621 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPAP53621 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPAP53621 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPAP53621 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms