Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP53609 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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