Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSBP53539 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOSBP53539 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOSBP53539 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOSBP53539 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOSBP53539 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOSBP53539 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOSBP53539 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOSBP53539 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms