Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBX2P52951 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX2P52951 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBX2P52951 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBX2P52951 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBX2P52951 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBX2P52951 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBX2P52951 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBX2P52951 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBX2P52951 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBX2P52951 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms