Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms