Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms