Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC34P49427 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms