Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA8P48165 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA8P48165 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA8P48165 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms