Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA4P43358 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms