Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRPPRCP42704 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRPPRCP42704 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms