Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHI3L1P36222 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHI3L1P36222 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms