Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP6P35125 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP6P35125 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP6P35125 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP6P35125 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP6P35125 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP6P35125 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP6P35125 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP6P35125 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP6P35125 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP6P35125 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP6P35125 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP6P35125 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
USP6P35125 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP6P35125 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP6P35125 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP6P35125 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP6P35125 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP6P35125 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP6P35125 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP6P35125 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP6P35125 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP6P35125 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP6P35125 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP6P35125 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP6P35125 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP6P35125 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP6P35125 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6P35125 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6P35125 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms