Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPC1P35052 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPC1P35052 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPC1P35052 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GPC1P35052 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPC1P35052 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC1P35052 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC1P35052 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms