Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms