Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CLIP1P30622 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms