Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPOP30536 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPOP30536 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPOP30536 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms