Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms