Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms