Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX2P28328 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX2P28328 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX2P28328 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX2P28328 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms