Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms