Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms