Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms