Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKACBP22694 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms