Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPRR1BP22528 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms