Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1P21675 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1P21675 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1P21675 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1P21675 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1P21675 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1P21675 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1P21675 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1P21675 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1P21675 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1P21675 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1P21675 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1P21675 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1P21675 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1P21675 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1P21675 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1P21675 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1P21675 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1P21675 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1P21675 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1P21675 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1P21675 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1P21675 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms