Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms