Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms