Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms