Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIG1P18858 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIG1P18858 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIG1P18858 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIG1P18858 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIG1P18858 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIG1P18858 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIG1P18858 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIG1P18858 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIG1P18858 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIG1P18858 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIG1P18858 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIG1P18858 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms