Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR1P18146 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR1P18146 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR1P18146 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR1P18146 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR1P18146 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR1P18146 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR1P18146 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms