Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD46P15529 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD46P15529 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD46P15529 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD46P15529 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD46P15529 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD46P15529 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD46P15529 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD46P15529 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms