Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms