Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT13P13646 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT13P13646 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT13P13646 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT13P13646 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT13P13646 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT13P13646 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT13P13646 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT13P13646 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT13P13646 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT13P13646 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT13P13646 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms