Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms