Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYL1P12980 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYL1P12980 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYL1P12980 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYL1P12980 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYL1P12980 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms