Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1P11387 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1P11387 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1P11387 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1P11387 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms