Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms