Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms