Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARBP10826 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARBP10826 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARBP10826 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RARBP10826 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RARBP10826 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARBP10826 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms