Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms