Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HKR1P10072 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HKR1P10072 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HKR1P10072 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms