Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM225BP0DP42 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms