Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM10L2BP0DMW5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms