Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms