Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSN3P07498 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSN3P07498 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN3P07498 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN3P07498 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN3P07498 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms