Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFMP07197 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFMP07197 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFMP07197 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFMP07197 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFMP07197 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFMP07197 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFMP07197 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFMP07197 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms