Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POMCP01189 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMCP01189 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMCP01189 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMCP01189 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POMCP01189 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POMCP01189 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POMCP01189 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMCP01189 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMCP01189 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMCP01189 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMCP01189 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMCP01189 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMCP01189 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POMCP01189 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POMCP01189 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POMCP01189 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMCP01189 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms